JMP 17/JMP Pro 17を用いたゲノム解析の紹介
概要編
JMP Pro 17には、JMP Genomics(2022年に提供終了)からゲノム解析の機能の一部が移行されています。さらに、既存の分析機能も、大規模な横長データに対応し、高速化のオプションが追加されました。
これらを組み合わせることにより、表現型と遺伝子群の関連を見つけたり、シミュレーションから交配実験の組み合わせを絞り込んだりすることができます。
そこで、JMP Pro 17をご利用中および購入を検討されている方々、またJMPからの移行を検討されている方々に、JMP Pro 17を用いたゲノム解析の概要と応用事例をご紹介します。
このオンデマンドセミナーでは、「概要編」を視聴いただけます。
視聴対象
- 現在JMP Proをご利用中の方
- JMP Proの新規導入をご検討されている方
- JMPからJMP Proへの移行をご検討されている方
内容
ゲノム解析に使われるデータの形式や分析機能、およびそれらを組み合わせた分析ワークフローをご紹介します。
前半では、分析に適用するデータテーブルの操作と、遺伝子発現率からの予測モデルの作成例をご紹介します。
後半では、遺伝子マーカーデータからのシミュレーションに予測モデルを適用して、実際の交配実験の組み合わせを絞り込む例をご紹介します。
・JMPのデータ分析ワークフロー
・読み込みできるファイルの種類
・遺伝子発現率からの予測モデルの作成例
・パターンや分類構造の可視化
・遺伝子マーカーのシミュレーションによる
実験条件の絞り込み