正規混合クラスター分析の例

サイトメトリー（Cytometry）は、細胞のさまざまな特徴を測定するのに使用されます。細胞マーカーを測定することは、特定の疾病を診断するのに役立ちます。この例では、サイトメトリーで測定した4つのマーカーに基づいてオブザベーション（データ行）をクラスターに分類します。

1. ［ヘルプ］>［サンプルデータライブラリ］を選択し、「Cytometry.jmp」を開きます。

2. ［分析］>［クラスター分析］>［正規混合］を選択します。

3. 「CD3」、「CD8」、「CD4」、「MCB」を選択して［Y, 列］をクリックします。

4. ［OK］をクリックします。

5. 「クラスターの数」の下に「6」と入力します。

6. ［実行］をクリックします。

注: このアルゴリズムではランダムな初期値が使用されるため、結果は分析の度にわずかに異なります。

図14.2 正規混合 クラスター数=6 

「クラスター要約」レポートには、6個の各クラスターに含まれるオブザベーションの数（データの行数）が表示されます。「クラスター平均」レポートには、4変数それぞれの、クラスターごとの平均が表示されます。

7. 「正規混合 クラスター数=6」の横の赤い三角ボタンをクリックし、［三次元バイプロット］を選択します。

注: このアルゴリズムではランダムな初期値が使用されるため、結果の三次元バイプロットは分析を行う度にわずかに異なります。

図14.3 Cytometryデータの三次元バイプロット 

このプロットには、クラスターにあてはめられた多変量正規分布の密度等高面が表示されます。最初の3つの主成分に基づいた場合、1つのクラスターが他のクラスターとは際立って離れているようです。

より詳細な情報が必要な場合や、質問があるときは、JMPユーザーコミュニティで答えを見つけましょう (community.jmp.com).