在本例中,您使用 Cytometry.jmp 样本数据表通过“K 均值聚类”对观测进行聚类。血细胞计数用于检测细胞表面的标记,这些标记的读数有助于诊断某些疾病。在本例中,基于血细胞计数分析中四种标记的读数来对观测进行分组。
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选择分析 > 聚类 > K 均值聚类。
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点击确定。
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在聚类数旁边输入 3。
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在聚类范围旁边输入 15(可选)。
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点击执行。
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图 12.2 “聚类比较”报表
图 12.3 “K 均值聚类数=11”报表
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点击“K 均值聚类数=11”红色小三角,然后选择平行坐标图。
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图 12.4 血细胞计数数据的“平行坐标图”
“平行坐标图”显示每个聚类中观测的结构。使用这些图可查看聚类有哪些不同。聚类 4、6、7、8 和 9 往往有相对低的 CD8 值和高的 CD4 值。另一方面,聚类 1 有更高的 CD8 值和更低的 CD4 值。
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图 12.5 血细胞计数数据的“双标图”
标识聚类颜色的图例显示在图的右侧。基于聚类前两个主成分,聚类 3、10 和 11 显示为与其他聚类分的最开。图 12.4中这几个聚类的平行坐标图支持该结论,它们与其他聚类的图有所不同。使用该图下面的列表可查看其他主成分组合的双标图。