SynbiCITE首席执行官Stephen Chambers参观伦敦DNA铸造厂(London DNA Foundry)时形容它是合成生物学家的创作空间。
客户案例
一个可实现生物学研究商业化的新生态系统
借助帝国理工学院(Imperial College)的合成生物学加速器SynbiCITE,统计分析将学科知识转化为最先进的研究
SynbiCITE
挑战 | 提高从工程生物系统获得的数据的重现性,从而将研究和想法转化为商业机会。 |
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解决方案 | SynbiCITE使用JMP提供系统的实验方法,帮助研究科学家实现验证和扩展成功商业应用所需的数据质量。 |
结果 | 新的产品和服务现在已经进入市场。这些成功已经推动新公司的创立、带动就业和加快公共资金的投资回报。 |
在今天的学术界,科学学科之间的界限已经变得越来越模糊。这些交叉学科中最新的一个学科是合成生物学,这是一个将生物学、化学和工程学结合在一起的领域。合成生物学正在彻底改变我们设计生物系统的方式;这一学科超越了学术研究范围,当前的使命是结合具体的工业、技术和生物医学应用打造新的产品和服务。如今的合成生物学是40年前的分子生物学的真实写照 - 正在掀起新一波应用生物创新的浪潮,进而推动现代科学经济的蓬勃发展。
2013年,SynbiCITE由英国政府、个人和学术合作伙伴共同投 资2800万英镑(3900万美元)在英国成立,作为合成生物学加速器,SynbiCITE致力于将新兴的生物研究与商业机会结合起 来。该组织的核心设施是位于帝国理工学院的伦敦DNA铸造厂 (London DNA Foundry)。在这里,科学家们可以使用尖端的机 器人设备从头到尾设计、构建和验证基因构建体。除了供应设备之外,该铸造厂还通过具有广泛专业知识的多元化员工提供教育计 划、指导和工程设计以及商业化支持。
因此,这里的专业知识和技能一开始就立于科技前沿。帝国理工学 院SynbiCITE的首席执行官Stephen Chambers博士是一位持续 创业的企业家,拥有分子生物学博士学位、生物工程学硕士学位以及生物化学学士学位。他还担任帝国理工学院合成生物学的创业培 训计划Lean LaunchPad的教学负责人,并通过自动化和实验设计 (DOE)持续研究工程生物学领域的最新成果。Chambers不仅提供了 宝贵的资源,还提供了企业愿景,使SynbiCITE始终处于工程生物 学商业化的前沿。
从生物学家到设计师再到创业家
合成生物学也标志着生物学表现方式的转变。“传统的生物学家不再是湿实验室科学家,他们现在更像是设计师,”Chambers解释 道。“从本质上讲,这些生物学家或者说设计师正在通过DNA编码来构建生物体,进而创造万事万物。”然而,验证和扩展这些实验 可能会很复杂,并且需要昂贵的设备和财力资源,远远超出大多数 初创公司和中小企业的能力范畴。
“这正是伦敦DNA铸造厂的职责所在,它为合成生物学家提供了一 个制造商空间,”Chambers说道。“在伦敦DNA铸造厂,生物学家可以快速地构建并测试原型,以确定其是否可行,而无需做出巨 大的投资。”铸造厂的工程师与“设计师”一起践行这些想法,促进形成一个更快速、更系统化、更具重现性的流程或原型。借助这 些可操作的工作原型,生物学家可以更清楚地向投资者展示成果的可行性,从而吸引资金注入并开发出可扩展的基础架构。
为了推动诸多合成生物学创新项目的落地生根,一系列相关的创业 活动日益增加,这也使得伦敦DNA铸造厂的作用越来越重要。按照传统模式,新技术最初先在大学里面发展起来,并衍生为新公 司。“参与其中的群体通常是系主任、教授等,”Chambers说道,这些衍生公司会得到大学的支持和培育。“尤其是在合成生物学领域,我们现在看到的现象是,初创企业仍然由大学人员创立, 这些人员还包括学生和毕业生,但是他们不再从大学获得技术授权。这些初创公司没有大学衍生公司所拥有的那些支持或资源,正是这些公司不断涌向铸造厂。
宣扬重现性的重要性
为了促进一致的质量并取得成功,以及为了在某些情况下获得监管部门的批准,精心设计的可重现的实验是关键所在。“当我们扩大规模时,我们通过设计显著地提升了质量......这完全取决于对数据的 信心和数据的严密性,以便您可以向其他人展示并让他们确信我们 所谈论的内容是真实的,”Chambers说道。
生物学是一门非常复杂的学科,在实验过程中需要综合考虑各种因素,因此,有时难以确定问题的根源并再现结果。通常,生物学家 缺乏统计专业知识或先见之明,没有从项目开始就实施“质量源于 设计”(Quality by Design)的方法,这就迫使他们依靠最佳猜测和 传统思维实施实验。
作为SynbiCITE的首席执行官,Chambers向他的生物学家和工 程师宣扬统计学的重要性,因为他从自己以往的实验室经验中已了 解到了统计的价值。Chambers十分清楚,并非所有的科学家都对 稳健的统计分析有所了解或感兴趣。“当您将[统计学]引入生物环 境时,最初会遭到抵触,”他解释道。“他们不喜欢实验设计被束 缚。但当看到结果时,他们就开始认同了。”
JMP提供了一个统计软件包,可供那些对统计数据知之甚少的生物学家访问,同时还会提供功能强大的分析工具和可视化工具。在DNA铸造厂工作人员的指导下,这些生物学家在几天内就可以开始使用并运行JMP,使他们能够开展标准化方法的相关研究,并获得 开拓新事业所需的成果类型和质量。
此外,借助JMP的灵活性和可视化功能,这些科学家可以了解他们的数据正在发生什么变化,并根据新的发现快速调整模型。“JMP 的可视化确实很有帮助,这一点很关键。”Chambers说道。“科学家可以借此开始观察他们的实验并了解这些实验的发现。”针对缺乏实验设计经验和其他统计技术的生物学家,JMP为他们提供了 一些实用的工具,让他们将想法变为现实,并向投资者展现他们的 潜力。
JMP的可视化确实很有帮助,这一点很关键。科学家们可以借此开始观察他们的实验并了解这些实验的发现。
帝国理工学院SynbiCITE首席执行官,Stephen Chambers
改变谈话的方式
尽管围绕某些生物创新的沉默可以理解,例如转基因生物的发布, 但只有整个合成生物学研究领域的科学严谨性和再现性得到提升, 才能帮助改变态度。更有希望看到的现象是,随着新产品投放市 场,合成生物学的倡导者可以针对严重问题展示真正的解决方 案。“例如,Novartis最近获得批准新推出的基因疗法Kymriah, 使用设计出的CAR T细胞成功治疗了儿童白血病,这将改变我们治 疗癌症的方式。现在我们拥有真实的产品,我们可以展示这些产品 并吸引人们的关注。”这些成功案例有助于培养消费者和投资者的 信心。
自成立以来,SynbiCITE 和伦敦DNA铸造厂通过转化研究成果、创立新的初创公司、在合成生物学公司带来更多 的就业机会和个人投资机会, 从公共资金中获得了显著的 投资回报, 并带来了经济效益。展望未来, SynbiCITE正逐渐将目光投向想要在伦敦DNA 铸造厂挖掘合成生 物学潜能的私营部门、行业合作者以及大大小小的客户 群体。