標準的なランダム係数モデルは、個体ごとの切片と傾きがランダムに分布しているモデルです。yijを、第i個体におけるj番目の測定値とします。単回帰のランダム係数モデルは次のようなモデルです。
この式で、
および
上記のモデルは、下式のようにも表されます。JMPでは、下式に基づいて、その固定効果と変量効果が推定されます。
Gとeijは、前述のように定義されます。