火山图示例

使用“响应筛选”平台确定哪些 SNP 与四个不同的特征相关。SNP 是一种遗传变异。火山图有助于直观演示大量相同类型的假设检验的结果。在这种情况下，所有响应和变量都是连续的，所以所有检验都来自简单线性回归。

1. 选择帮助 > 样本数据文件夹 > 生命科学，然后打开 Genotypes Pedigree.jmp。

2. 选择分析 > 筛选 > 响应筛选。

3. 从特征1 一直选择到特征4，然后点击 Y，响应。

4. 选择标记列组，然后点击 X。

5. 选择公共 Y 尺度和公共 X 尺度。

6. 点击确定。

7. 选择“斜率-LogWorth”选项卡。

图 24.17 “斜率-LogWorth”图 

“斜率-LogWorth”图（亦称火山图）中的着色点在控制假发现率的同时指示在 0.01 水平下显著的检验。在本例中，图中只有红点。这指示所有显著的 X 变量在简单线性回归中都具有正斜率。因此，对于所有与特征显著相关的 SNP，较高的 SNP 值导致较高的特征值。“结果表”显示来自各个检验的结果，最显著的检验位于顶部。所有顶部检验都涉及特征 1 和特征 2。您可以得出结论：这组 SNP 与“特征 1”和“特征 2”的相关性高于其他两个特征。

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